2022 年第 7 期 第 20 卷

基于生物信息学分析prohibitin在肾透明细胞癌中的表达及意义

作者：杨文军，朱炜玮

单位：1.解放军总医院第六医学中心急诊医学科2.解放军总医院第七医学中心泌尿外科

关键词：prohibitin 肾透明细胞癌 数据库分析 生物信息学

• 摘要：
• 【摘要】目的 通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库分析prohibitin(PHB)在肾透明细胞癌中的表达及与患者临床特征和预后的关系，为研究肾透明细胞癌的发病机制及治疗方法提供新思路。方法 通过TCGA、人类蛋白质图谱（HPA）数据库检索PHB基因在人体正常组织中的表达情况，通过UALCAN数据库分析PHB基因在肾透明细胞癌组织与正常肾组织中的表达水平，并分析PHB表达水平与肾透明细胞癌患者临床特征和预后的关系，利用String数据库预测与PHB基因相互作用的蛋白，并进行基因本位（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。结果 PHB基因在肾透明细胞癌组织中的相对表达量明显低于正常肾脏组织（P﹤0.01）。男性、未分化肾透明细胞癌患者肿瘤组织PHB基因相对表达量分别低于女性、低中高分化患者（P﹤0.05）。PHB低表达肾透明细胞癌患者总生存期短于PHB高表达患者（P﹤0.05）。将交集靶点导入String数据库，得到蛋白质互作网络，共筛选出20个与PHB基因相互作用的蛋白。GO分析结果显示，细胞成分主要集中于细胞内液、细胞质、细胞质膜及线粒体等，生物进程主要集中于细胞内信号转导、细胞死亡调控及细胞凋亡调控等，分子功能主要集中于蛋白结合、ATP结合、蛋白酶激活等；KEGG通路富集分析主要富集于磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B(AKT)信号通路、免疫反应相关通路等。结论 PHB在肾透明细胞癌组织中低表达，PHB表达水平可作为肾透明细胞癌患者诊断、治疗及预后评估的潜在分子标志物。