2021 年第 8 期 第 19 卷

肾癌环状 RNA 表达谱和调控通路分析

作者：纪梓良1，路瑞静2，陈忠1，温志强1，郑清友1

单位：1南方医科大学深圳医院泌尿外科，2深圳市宝安区妇幼保健院检验科

关键词：环状RNA肾癌表达谱调控网络

• 摘要：
• 【摘要】

  目的 检测肾癌环状 RNA（circRNA）表达谱并预测其调控通路。方法 对 3 例肾癌患者的肾癌组织

  及癌旁正常肾组织标本进行高通量测序，结合生物信息学的方法预测差异表达的 circRNA 在肾癌中的调控通

  路。结果 共鉴定出 4661 个 circRNA，其中 1963 个为新发现的 circRNA，89.89%（4190/4661）circRNA 是外显子

  circRNA，其余的 circRNA 包括 4.66%（217/4661）内含子 circRNA 和 5.45%（254/4661）基因间 circRNA。这些 circRNA 广泛分布在整个人类染色体中，其中 2 号染色体包含 463 个 circRNA，而 Y 染色体仅包含 10 个 circRNA。

  circRNA 的长度为 78~181 652 nt，其中位长度为 652 nt，43.77%的 circRNA 长度为 200~600 nt。与癌旁组织相比，

  肾癌组织中发现 53 个显著异常表达的 circRNA，包括 21 例上调和 32 例下调的 circRNA（倍数≥2.0，P﹤0.05）。分

  别选取表达差异倍数最高的 4 个上调和下调的 circRNA，构建 circRNA/微小 RNA（miRNA）/mRNA 调控网络，有

  助于预测circRNA在肾癌中的调控通路。结论 本研究阐明了肾癌circRNA的表达模式和差异表达的circRNA，

  并预测及构建了circRNA/miRNA/mRNA调控网络，用于指导后期关于肾癌circRNA的研究。