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2021 年第 11 期 第 19 卷
生物信息学方法鉴定与肾透明细胞癌预后相关的关键基因
作者:何天基1,陈翔1,王伟1,刘峰2,蔡孟会2,石海林2#
单位:广西医科大学附属柳州市人民医院泌尿外科,广西柳州545006 桂林医学院附属医院泌尿外科,广西桂林5410010
关键词:肾透明细胞癌生物信息学关键基因肿瘤基因图谱基因表达汇编
- 摘要:
- 【摘要】
目的 采用生物信息学方法鉴定与肾透明细胞癌(KIRC)预后相关的关键基因,并进一步分析其临床
意义。方法 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)中
KIRC的基因表达谱数据,提取与正常肾组织差异表达的关键基因,结合TCGA数据库中的生存时间进行预后分
析。结果 在 TCGA 和 GEO 数据库中共分析得到 112 个重叠基因,鉴定出 10 个 KIRC 关键基因(RAB25、ESRP1、
EPCAM、VEGFA、MAL2、GRHL2、AP1M2、GPC3、CP、OCLN),OCLN高表达患者的总生存期(OS)长于OCLN低表
达患者,而GPC3、RAB25及GRHL2低表达患者的OS分别长于GPC3、RAB25及GRHL2高表达的患者,差异均有
统计学意义(P﹤0.05);OLCN 及 MAL2 高表达患者的无病生存期(DFS)分别长于 OLCN 及 MAL2 低表达患者,
GPC3 及 CP 低表达患者的 DFS 分别长于 GPC3 及 CP 高表达患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论 本研
究采用生物信息学方法鉴定出了与 KIRC 预后相关的关键基因,其中 OCLN、RAB25、GRHL2 及 GPC3 与 KIRC 患
者的OS有关,而OLCN、GPC3、CP及MAL2与KIRC患者的DFS有关,这可能成为未来恶性肿瘤治疗的新靶点。